-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathVC_Seminaire1_Msc.tex
736 lines (546 loc) · 25.7 KB
/
VC_Seminaire1_Msc.tex
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
\documentclass[aspectratio=169]{beamer}
\usetheme[]{metropolis} % Use metropolis theme;
%\usepackage{FiraSans}
\usepackage{appendixnumberbeamer}
\usepackage[absolute,overlay]{textpos}
\usepackage[T1]{fontenc}
\usepackage{setspace}
\usepackage{xcolor}
\usepackage{caption}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% Background setup
\pgfdeclareimage[width=\paperwidth,height=\paperheight]{bg2}{figs/bg2} % Declare background image
\defbeamertemplate*{background canvas}{mydefault}
{%
\ifbeamercolorempty[bg]{background canvas}{}{\color{bg}\vrule width\paperwidth height\paperheight}% copied beamer default here
}
\defbeamertemplate*{background canvas}{bg}
{%
\color{mDarkTeal}\vrule width\paperwidth height\paperheight% added bg color
}
\defbeamertemplate*{background canvas}{image}
{%
\begin{tikzpicture}
\useasboundingbox (0,0) rectangle (\the\paperwidth, \the\paperheight);
\pgftext[at=\pgfpoint{0cm}{0cm}, left, base]{\pgfuseimage{bg2}};
\end{tikzpicture}
}
\BeforeBeginEnvironment{frame}{%
\setbeamertemplate{background canvas}[mydefault]%
}
\makeatletter
\define@key{beamerframe}{bg}[true]{%
\setbeamertemplate{background canvas}[bg]%
}
\makeatletter
\define@key{beamerframe}{image}[true]{%
\setbeamercovered{invisible}%
\setbeamertemplate{background canvas}[image]%
}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%% General setup
%% Fonts and typography
\setbeamerfont{title}{size=\huge,%
series=\bfseries}
\setbeamerfont*{subtitle}{size=\Large,%
series=\bfseries}
\setbeamerfont{author}{size=\large}
\setbeamerfont{date}{size=\large}
\setbeamerfont{frametitle}{size=\Large,%
series=\bfseries}
% color
\setbeamercolor{titlelike}{use=palette primary, parent=palette primary}
\setbeamercolor{author}{use=palette primary, parent=palette primary}
\setbeamercolor{date}{use=palette primary, parent=palette primary}
\setbeamercolor{institute}{use=palette primary, parent=palette primary}
\setbeamercolor{structure}{use=palette primary, parent=palette primary}
\setbeamertemplate{title}{
\flushleft%
\setstretch{.85}%
\inserttitle%
\par%
\vspace*{0.1em}
}
\setbeamertemplate{subtitle}{
\raggedright%
\setstretch{.85}%
\insertsubtitle%
\par%
\vspace*{0.5em}
}
% Title page frame
\setbeamertemplate{title page}{
%\pgfdeclareimage[height=0.6cm]{logo}{UdeS_blanc} % Declare first Logo
%\pgfdeclareimage[height=0.45cm]{logo2}{IELab} % Declare second Logo
\begin{minipage}[b][\paperheight]{10cm}
\ifx\inserttitlegraphic\@empty\else\usebeamertemplate*{title graphic}\fi
\vfill%
\ifx\inserttitle\@empty\else\usebeamertemplate*{title}\fi
\ifx\insertsubtitle\@empty\else\usebeamertemplate*{subtitle}\fi
%\usebeamertemplate*{title separator} % puts a line under the title
\ifx\beamer@shortauthor\@empty\else\usebeamertemplate*{author}\fi
\ifx\insertdate\@empty\else\usebeamertemplate*{date}\fi
\ifx\insertinstitute\@empty\else\usebeamertemplate*{institute}\fi
%\vfill%
\vspace*{8mm}
%\pgfuseimage{logo} % Use logo
%\newcommand\mybar{\kern1pt\rule[-\dp\strutbox]{.8pt}{.7cm}{\hspace{2mm}}\kern1pt} % White bar
%\textcolor{white}{\mybar{\pgfuseimage{logo2}}} % Second logo
%\vfill
\vspace*{15mm}
\end{minipage}
}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% Examples
%% Makes title slide with only background defined color
%\begin{frame}[bg]
%\titlepage
%\end{frame}
%% Makes a title slide with background + image
%\begin{frame}[image]
%\titlepage
%\end{frame}
%% Makes also a title slide with background + image
%\maketitle
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\title{Aire de distribution et changements climatiques:}
\subtitle{Comment les interactions biotiques moduleront-elles la réponse?}
%\date{\today}
\author{Victor Cameron}
\begin{document}
%% Effect of climate change on the co-distribution of forest trees and passerine birds
\maketitle % make title produces formated title slide
%%% keys
%1. Le titre
%2. En écologie, spécialement avec les c.c. nous sommes intéressés à comprendre ce qui détermine la distribution des espèces
%3. L'aire de distribution d'une espèce est limitée
%4. Une connaissance des processus limitant l'aire de distribution est fondamentale pour prévoir les distributions dans le futur
%5. Structure spéciale: Étude théorique = descriptif
%6. Pas d'hypothèse
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%% Contexte
%{%
%\setbeamertemplate{frame footer}{Ferrarini \textit{et al}. 2017}
%\begin{frame}{Contexte\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Les limites de distribution}}}
% Un \textbf{déplacement des aires de distribution} est attendu dans les 100 prochaines années
% \begin{figure}
% \includegraphics[height=.60\paperheight]{figs/Ferrarini.png}
% %\caption*{ \textbf{Eveloppe climatique de l'érable à sucre présente et projetée (2071-2100)}}
% \end{figure}
%\end{frame}
%}
%%% L'aire de distribution d'une espèce est limitée
%%% Une connaissance des processus limitant l'aire de distribution est fondamentale pour prévoir les distributions dans le futur
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%% Contexte
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{}
\begin{frame}{Contexte\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Les limites de distribution}}}
L'emplacement des limites de distribution est \textbf{sensible au climat}
\begin{figure}
\includegraphics[height=.65\paperheight]{figs/corridor.jpg}
%\caption*{ \textbf{Distribution présente et projetée}}
\end{figure}
\end{frame}
}
%%% On s'attend à trouver les espèces là où le climat est favorable et absentes là où le climat est défavorable
%%% La distribution est l'espace géographique où l'espèce se trouve
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%% Contexte
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{Ferrarini \textit{et al}. 2017}
\begin{frame}{Contexte\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Projection des futures distributions}}}
On s'attend à ce que les enveloppes climatiques se \textbf{déplacent vers le nord ou vers des altitudes plus élevées}
\begin{figure} % Photos de passeraux associés à divers types de forêts
% Paruline azurée (ou couronnée?) est associée aux érablières
\includegraphics[width=0.5\textwidth]{figs/Ferrarini.png}
\end{figure}
\end{frame}
}
%%% Les espèces réactives pourront suivre le déplacement de leur enveloppe climatique
%%% Les espèces moins réactives accuseront un retard
%%% Il a été observé que la végétation accuse un retard sur le déplacement son enveloppe climatique
%%% Différents temps de réactions peuvent faire que des espèces qui co-occurent présentement ne co-occurent plus dans le futur
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%% Contexte
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{McKenney \textit{et al}. 2007, Talluto \textit{et al}. 2017}
\begin{frame}[t]{Contexte\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Difficultés reliées au contexte}}}
Les \textbf{modèles de distribution d'espèces} (SDMs) sont des modèles mathématiques qui corrèlent la \emph{distribution} d'une espèce avec des \emph{données climatiques}
\begin{columns}[]
\begin{column}{0.5\textwidth}
\begin{figure}
\includegraphics[height=.65\textwidth]{figs/Talluto2.png}
\end{figure}
\end{column}
\begin{column}{0.5\textwidth}
\includegraphics[height=.65\textwidth]{figs/mckenney.png}
\end{column}
\end{columns}
\end{frame}
}
%% Les SDMs sontdes modèles mathématiques
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%% Contexte
\begin{frame}{Contexte\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Difficultés reliées au contexte}}}
Les \textbf{modèles de distribution d'espèces} (SDMs) font de nombreuses suppositions:
\begin{itemize}
\item Distribution à l'équilibre avec l'enveloppe climatique;
\item Absence de démographie;
\item Absence de limite de dispersion;
\item Absence d'interaction entre espèces;
\item Réponse linéaire et instantanée aux changements climatiques.
\end{itemize}
\end{frame}
%% Les outils actuels pour prédire l'impact des changements climatiques sur la distribution des espèces sont limités par l'absence de processus écologiques fondamentaux.
%% Def interaction: l'effet qu'une espèce a sur le fitness d'une autre espèce (taux de croissance de population): pred-proie, habitat-utilisateur
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % % Contexte
\begin{frame}{Contexte\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Difficultés reliées au contexte}}}
%% Quand on s'intéresse au changements d'aire de répartition d'une communauté, certains processus sont à prendre en considérations:
Les espèces qui \textbf{co-occurent}:
\begin{itemize}
\item Ont différents temps de réponse aux changements climatiques;
\item Ne se reproduisent pas au même rythme;
\item N'ont pas toutes la même capacité de dispersion;
\item Interagissent.
\end{itemize}
\alert{Ces processus peuvent modifier la relation entre le climat et la distribution des espèces}
\end{frame}
%% Les processus peuvent avoir des conséquences inatendues sur les futures distributions
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Objectifs\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{}}}
\textbf{Objectif général:} Évaluer les impacts des changements climatiques sur la distribution régionale d'une espèce en interaction avec un habitat en modification.
\begin{figure}
\includegraphics[height=.50\paperheight]{figs/monarque.jpg}
\end{figure}
\end{frame}
%% Interaction: L'habitat --> arbre est une espèce
%% Eg. Monarque a besoin de l'asclépiade(habitat); ne peut pas se déplacer
%% Eg. Tamias - chêne; ail des bois - érables
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Objectifs\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{}}}
\textbf{Objectif général:} Évaluer les impacts des changements climatiques sur la distribution régionale d'une espèce en interaction avec un habitat en modification.
\textbf{\\Objectifs secondaires:}
\begin{enumerate}
\item Développer un outil théorique pour améliorer la prédiction des impacts des changements climatiques sur la distribution des espèces;
\item Évaluer l'impact des interactions biotiques sur la réaction des aires de distribution aux changements climatiques.
\end{enumerate}
\end{frame}
%% Interaction: L'habitat --> arbre est une espèce
%% Eg. Monarque a besoin de l'asclépiade(habitat); ne peut pas se déplacer
%% Eg. Tamias - chêne; ail des bois - érables
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{Pulliam 2000, Sandoro 2008}
\begin{frame}{Théorie \hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Interactions biotiques}}}
Les \textbf{interactions biotiques} sont d'importantes forces modulaires des limites de distribution à \emph{petites et à grandes échelles spatiales}
\begin{figure}
\includegraphics[height=.50\paperheight]{figs/Sandoro.png}
\caption*{Distribution de l'écureil roux (gauche) et de l'écureuil gris (droit).}
\end{figure}
\end{frame}
}
%% Interaction biotiques: effet d'une espèce sur le fitness (taux de croissance) d'une autre espèce
%% Historiquement: Conditions climatiques importantes à large échelle, et les interactions à l'échelle locale
%% Little interest in the study of biotic interactions at large geographical scales: important need for methods to account for interactions in future predictions
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{Pulliam 2000, Godsoe \textit{et al}. 2017}
\begin{frame}{Théorie\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{La niche écologique}}}
La \textbf{niche fondamentale} fait référence aux \emph{conditions climatiques}: là où l'espèce \emph{peut} être présente
\vspace{1em}
\begin{equation*}
\underbrace{r(E)}_{\text{croissance}} > \underbrace{b(E)}_{\text{naissances}} - \underbrace{d(E)}_{\text{mortalité}}
\end{equation*}
\begin{columns}[]
\begin{column}{0.5\textwidth}
\begin{figure}
\includegraphics[width=0.8\textwidth]{figs/pulliam1.png}
\end{figure}
\end{column}
\begin{column}{0.5\textwidth}
\includegraphics[width=0.95\textwidth]{figs/godsoe1.png}
\end{column}
\end{columns}
\end{frame}
}
%% Godsoe: approche les limites de distribution avec la théorie de la niche (r>b-d)
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{Pulliam 2000, Godsoe \textit{et al}. 2017}
\begin{frame}{Théorie\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{La niche écologique}}}
La \textbf{niche réalisée} fait référence aux \emph{conditions climatiques et autres facteurs}: là où l'espèce \emph{est} présente
\begin{equation*}
\underbrace{r(E)}_{\text{croissance}} > \underbrace{b(E)}_{\text{naissances}} - \underbrace{d(E)}_{\text{mortalité}} + \underbrace{I(E)}_{\text{interactions}}
\end{equation*}
\begin{columns}[]
\begin{column}{0.5\textwidth}
\begin{figure}
\includegraphics[width=0.8\textwidth]{figs/pulliam2.png}
\end{figure}
\end{column}
\begin{column}{0.5\textwidth}
\includegraphics[width=.9\textwidth]{figs/godsoe2.png}
\end{column}
\end{columns}
\end{frame}
}
%% Besoin d'une perspective régionale (\lambda>c-e --> suget de ma maitrise (montrer les schémas que j'ai fait)
%% Ajout de processus biotiques (vs. abiotiques)
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{Schooley and Consentino 2018}
\begin{frame}{Théorie\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Métapopulations}}}
\begin{columns}
\only<1-2>{%
\begin{column}{0.5\textwidth}
\begin{figure}
\includegraphics[width=.60\paperheight]{figs/metapop.png}
\caption*{Une métapopulation}
\end{figure}
\end{column}
}
\only<1>{%
\begin{column}{0.5\textwidth}
\end{column}
}
\only<2>{%
\begin{column}{0.5\textwidth}
\begin{equation*}
\frac{dP}{dt} = c(h-P) - eP
\end{equation*}
\vspace{1em}
\begin{description}
\item[P] proportion des patch occuppées
\item[c] taux de colonisation
\item[h] disponibilité de l'habitat
\item[e] taux d'extinction
\end{description}
\end{column}
}
\end{columns}
\end{frame}
}
%% Besoin d'une perspective régionale (\lambda>c-e --> suget de ma maitrise (montrer les schémas que j'ai fait)
%% h: disponibilité d'habitat --> patch habitable maintenant, mais peut être pas dans le futur à cause des c.c.
%% h>e/c --> condition de la distribution d'une espèce; h=e/c ou c*h=e est la limite de distribution
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Théorie\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Métapopulations}}}
\begin{equation*}
\textcolor{lightgray}{\underbrace{b(E^*)}_{\text{naissances}} - \underbrace{d(E^*)}_{\text{mortalité}} = 0}
\end{equation*}
\begin{equation*}
\underbrace{c(E^*)}_{\text{colonisations}} * \underbrace{h(E^*)}_{\text{disponibilité d'habitat}} - \underbrace{e(E^*)}_{\text{extinctions}} = 0
\end{equation*}
\begin{description}
\item[E*:] ensemble des conditions environementales à la limite de distribtution
\end{description}
\end{frame}
%% Une population est une patch individuelle, une métapopulation est un amalgame de plusieurs patchs
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Théorie\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Métapopulations}}}
La \textbf{capacité de métapopulation} est une mesure de la structure de l'habitat, c'est un proxy de la \emph{viabilité}
\begin{figure}
\includegraphics[width=.60\paperheight]{figs/metapop2.png}
\caption*{Une métapopulation}
\end{figure}
\end{frame}
%% La capacité de support est en quelque sorte une mesure du risque d'extinction de l'espèce; c'est une mesure de la structure de l'habitat (# patch, aire des patch; distances) tel qu'expérimenté par l'espèce sur sa persistence
%% Intéressent pour mesurer l'impact des changements climatiques sur une espèce à l'échelle régionale; différence dans la viabilité
%% Intéressent pour mesurer l'impact des interactions sur la réponse espèce à l'échelle régionale; différence dans le risque d'extinction avant-après
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Étude de cas\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Les Appalaches et la paruline rayée}}}
\begin{columns}
\begin{column}{0.6\textwidth}
\begin{figure}
\includegraphics[height=.65\paperheight]{figs/appalaches.png} % eg. grive et sa foret
%\caption*{ \textbf{}}
\end{figure}
\end{column}
\begin{column}{0.4\textwidth}
%\begin{columns}
% \begin{column}{0.5\textwidth}
\begin{figure}
\includegraphics[height=0.25\textheight]{figs/paruline_rayée.jpg}
\end{figure}
% \end{column}
% \begin{column}{0.5\textwidth}
% \begin{figure}
% \includegraphics[height=0.23\textheight]{figs/grive_des_bois.jpg}
% \end{figure}
% \end{column}
%\end{columns}
\begin{figure}
\includegraphics[height=0.45\textheight]{figs/corridor.jpg}
\end{figure}
\end{column}
\end{columns}
\end{frame}
%% La distribution à l'échelle régionale
%% Le passereau est dépendant des conditions climatiques et de son habitat
%% Son habitat est en retard sur les changements climatiques = mismatch
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Objectifs\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{}}}
\textbf{Objectif général:} Évaluer les impacts des changements climatiques sur la distribution d'espèces associées à un habitat en modification telle que la \emph{paruline rayée}.
\textbf{\\Objectifs spécifiques:}
\begin{enumerate}
\item Développer un outil théorique pour améliorer la prédiction des impacts des changements climatiques sur la distribution d'espèces associées à un habitat en modification;
\item Évaluer l'impact des interactions biotiques sur la réaction des aires de distribution aux changements climatiques.
\end{enumerate}
\end{frame}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Approche\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Développer un outil théorique}}}
1. Schématiser le problème
$$h(T) > \frac{e(T)}{c(T)}$$
\begin{figure}
\only<1>{\includegraphics[height=.50\paperheight]{figs/modele1.png}}
\only<2>{\includegraphics[height=.50\paperheight]{figs/modele2.png}}
\only<3>{\includegraphics[height=.50\paperheight]{figs/modele3.png}}
\end{figure}
\end{frame}
%% L'espèce à l'échelle régionale sera présente là où le ratio est suppérieur à la disponibilité de l'habitat (sa forêt)
%% Amène à une contraction de l'aire de distribution pour une espèce de sommet
%% Amène à une extension de l'aire de distribution pour un espèce associée à la base
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Approche\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Développer un outil théorique}}}
1. Schématiser le problème.
2. Traduire le problème en un \textbf{modèle de métapopulation} qui tiendra compte de \emph{la disponibilité d'habitat}, de \emph{la structure du paysage} et \emph{du climat}.
%\begin{equation*}
% \frac{dP_i}{dt} = c(T_i) \sum{exp(-\alpha d_ij)} f(T_j,A_j)(1-P_i) - e(T_i,A_i)P_i
%\end{equation*}
\begin{figure}
\includegraphics[height=.55\paperheight]{figs/appalaches.png}
\end{figure}
\end{frame}
%% Modèle réalistique (spatiallement explicite)
%% Une équation pour la probabilité que chaque patch soit occuppée
%% Prend en compte la distribution spatiale des patchs (montagnes) (aire, distance), le climat de chaque patch et la dispersion de l'espèce
%% Le modèle Prédira la distribution de l'espèce après un changement du climat
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}[t]{Approche\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{L'impact des interactions}}}
1. Schématiser le problème.
2. Traduire le problème en un \textbf{modèle de métapopulation} qui tiendra compte de \emph{la disponibilité d'habitat}, de \emph{la structure du paysage} et \emph{du climat}.
3. Mesurer la \textbf{capacité de métapopulation}.
% Figure du range (métapop) de l'espèce avant et après changements climatiques
\end{frame}
%% Objectif: mesurer l'impact sur l'ampleur de la réponse à l'échelle régionale (à l'échelle de la métapop)
%% En regardant le degré de réponse de l'habitat, l'effet des interactions sur la réponse pourra être observée sur le risque d'extinction de l'espèce apres changements climatiques
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}[t]{Approche\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{L'impact des interactions}}}
1. Schématiser le problème.
2. Traduire le problème en un \textbf{modèle de métapopulation} qui tiendra compte de \emph{la disponibilité d'habitat}, de \emph{la structure du paysage} et \emph{du climat}.
3. Mesurer la \textbf{capacité de métapopulation}.
4. Mesurer la \textbf{vitesse de réaction} de la métapopulation
\end{frame}
%% Objectif: mesurer l'impact sur la dynamique de la réponse; de la sensibilité de l'espèce auc c.c.
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Contributions\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{}}}
Mon travail contribuera à:
\begin{itemize}
\item Une meilleure compréhension de \textbf{l'effet des interactions} sur la réponse des espèces face aux changements climatiques;
\item Produira des \textbf{hypothèses} qui pourront être vérifiées sur le terrain;
\item Aidera Corridor Appalachien à \textbf{documenter le futur} des sommets de conifères et de certaines espèces.
\end{itemize}
\end{frame}
%% Mon travail amènera une meilleure compréhension de l'effet des interactions sur la réponse des espèces face aux changements climatiques qui était ingnorée des modèles de distribution d'espèce classiques alors qu'il y a d'importantes preuves de leur effet.
%% Prédiction des effets des changements climatiques sur la distribution plus précises
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}{Remerciements\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{}}}
\begin{columns}
\begin{column}{0.3\textwidth}
\textbf{Directeur de recherche}
Dominique Gravel
\par
\vspace{1em}
\textbf{Comité d'encadrement}
Mark Vellend
Marc Bélisle
Anna Hargreaves
\par
\vspace{1em}
Membres du laboratoire Gravel
\par
\vspace{1em}
Guillaume blanchet
\end{column}
\begin{column}{0.7\textwidth}
\par
\vspace{1em}
\includegraphics[width=\textwidth]{figs/corridor.jpg}
\end{column}
\end{columns}
\end{frame}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\begin{frame}[standout]
Questions?
\end{frame}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
\appendix
\begin{frame}{Appendice\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Modèle mathématique}}}{Backup slides}
Modèle spatiallement explicite de métapopulation
\begin{equation*}
\frac{dP_i}{dt} = c(T_i) \sum{exp(-\alpha d_ij)} f(T_j,A_j)(1-P_i) - e(T_i,A_i)P_i
\end{equation*}
\begin{figure}
\includegraphics[height=.50\paperheight]{figs/grive.png}
\end{figure}
\end{frame}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{Svenning \textit{et al}. 2014}
\begin{frame}{Appendice\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Réactivité}}}
\begin{description}
\item[S:] réactivité (vitesse) de l'espèce aux changements climatiques
\end{description}
\begin{equation*}
S = 2*\sqrt{rD}
\end{equation*}
\end{frame}
}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{}
\begin{frame}{Appendice\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Range shifts}}}
\begin{figure}
\includegraphics[height=.7\paperheight]{figs/fut_range.pdf}
\end{figure}
\end{frame}
}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% % %
{%
\setbeamertemplate{frame footer}{}
\begin{frame}{Appendice\hskip 1em \mdseries{\textcolor{lightgray}{Résumé}}}
\textbf{Q:} Quel est l'impact des interactions sur la réponse des espèces face aux changements climatiques
\begin{enumerate}
\item Les interactions peuvent affecter la distribution à l'échelle régionale
\item La forêt accusera un retard sur le déplacement des conditions climatiques
\item Les passereaux ont le potentiel de suivre le déplacement des conditions climatiques, mais ont besoin de leur habitat
\end{enumerate}
\end{frame}
}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\end{document}