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pres_psi(habitat)p(survey p obs).out
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PRESENCE - Presence/Absence-Site Occupancy data analysis
Tue May 30 20:56:35 2017, Version 12.0_170523.
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==>i=paodata.pao
==>j=.\pres36f012a51ad5.dm
==>l=pres_psi(habitat)p(survey p obs).out
==>
==>quiet
==>maxfn=32000
==>name=psi(Habitat)p(SURVEY + Obs)
==>lmt=1
varcov: nsig=6 eps=1.000000e-002
no model name N,T-->72,5
********* Input Data summary *******
Number of sites = 72
Number of sampling occasions = 5
Number of states = 0
Number of missing observations = 98
Data checksum = 53860
NSiteCovs-->2
site_covname[0]=psi.int
site_covname[1]=psi.Habitatunbrowsed
NSampCovs-->7
samp_covname[0]=p.int
samp_covname[1]=p.SURVEY2
samp_covname[2]=p.SURVEY3
samp_covname[3]=p.SURVEY4
samp_covname[4]=p.SURVEY5
samp_covname[5]=p.Obs2
samp_covname[6]=p.Obs3
Primary periods=1 Secondary periods: 5
Naive occupancy estimate = 0.4861
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Weta
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N=72 T=5 Groups=1 bootstraps=0
-->site 72
Matrix 1: rows=2, cols=3
-,a1,a2
psi 1 psi.Habitatunbrowsed
========================
Matrix 2: rows=6, cols=8
-,b1,b2,b3,b4,b5,b6,b7
p1 1 p.SURVEY2 p.SURVEY3 p.SURVEY4 p.SURVEY5 p.Obs2 p.Obs3
p2 1 p.SURVEY2 p.SURVEY3 p.SURVEY4 p.SURVEY5 p.Obs2 p.Obs3
p3 1 p.SURVEY2 p.SURVEY3 p.SURVEY4 p.SURVEY5 p.Obs2 p.Obs3
p4 1 p.SURVEY2 p.SURVEY3 p.SURVEY4 p.SURVEY5 p.Obs2 p.Obs3
p5 1 p.SURVEY2 p.SURVEY3 p.SURVEY4 p.SURVEY5 p.Obs2 p.Obs3
========================
Matrix 3: rows=0, cols=0
========================
Matrix 4: rows=0, cols=0
========================
Matrix 5: rows=0, cols=0
========================
Matrix 6: rows=0, cols=0
========================
modtype=1
Custom Model:
Number of significant digits = 6.8
Model has been fit using the logistic link.
Number of parameters = 9
Number of function calls = 281
-2log(likelihood) = 239.5994
AIC = 257.5994
Untransformed Estimates of coefficients for covariates (Beta's)
======================================================================
estimate std.error
A1 psi : 1.193314 0.675576
A2 psi.psi.Habitatunbrowsed : -1.169320 0.741073
B1 p1 : -1.299719 0.524556
B2 p1.p.SURVEY2 : -0.154892 0.550399
B3 p1.p.SURVEY3 : -0.943191 0.599690
B4 p1.p.SURVEY4 : -0.070655 0.562873
B5 p1.p.SURVEY5 : 1.035455 0.563890
B6 p1.p.Obs2 : 0.726461 0.467858
B7 p1.p.Obs3 : 1.070017 0.460056
============================================================
Individual Site estimates of <psi>
Site estimate Std.err 95% conf. interval
psi 1 site 1 : 0.7673 0.1206 0.4673 - 0.9254
============================================================
Individual Site estimates of <p1>
Site estimate Std.err 95% conf. interval
p1 1 site 1 : 0.2142 0.0883 0.0888 - 0.4325
p2 1 site 1 : 0.4050 0.1196 0.2047 - 0.6430
p3 1 site 1 : 0.1800 0.0814 0.0693 - 0.3927
p4 1 site 1 : 0.4255 0.1252 0.2135 - 0.6689
p5 1 site 1 : . . . - .
============================================================
DERIVED parameter - Psi-conditional = [Pr(occ | detection history)]
Site psi-cond Std.err 95% conf. interval
psi-cond 1 site 1 : 0.4208 0.2196 0.1105 - 0.8094
psi-cond 2 site 2 : 0.4208 0.2196 0.1105 - 0.8094
psi-cond 3 site 3 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 4 site 4 : 0.1841 0.1015 0.0566 - 0.4589
psi-cond 5 site 5 : 0.4208 0.2196 0.1105 - 0.8094
psi-cond 6 site 6 : 0.1841 0.1015 0.0566 - 0.4589
psi-cond 7 site 7 : 0.1841 0.1015 0.0566 - 0.4589
psi-cond 8 site 8 : 0.1841 0.1015 0.0566 - 0.4589
psi-cond 9 site 9 : 0.1841 0.1015 0.0566 - 0.4589
psi-cond 10 site 10 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 11 site 11 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 12 site 12 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 13 site 13 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 14 site 14 : 0.1347 0.0869 0.0349 - 0.4014
psi-cond 15 site 15 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 16 site 16 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 17 site 17 : 0.4765 0.2143 0.1445 - 0.8306
psi-cond 18 site 18 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 19 site 19 : 0.2204 0.1100 0.0746 - 0.4977
psi-cond 20 site 20 : 0.4170 0.2182 0.1097 - 0.8059
psi-cond 21 site 21 : 0.5459 0.2039 0.1934 - 0.8577
psi-cond 22 site 22 : 0.2719 0.1225 0.0999 - 0.5568
psi-cond 23 site 23 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 24 site 24 : 0.2719 0.1225 0.0999 - 0.5568
psi-cond 25 site 25 : 0.2719 0.1225 0.0999 - 0.5568
psi-cond 26 site 26 : 0.2885 0.1202 0.1140 - 0.5611
psi-cond 27 site 27 : 0.2885 0.1202 0.1140 - 0.5611
psi-cond 28 site 28 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 29 site 29 : 0.2885 0.1202 0.1140 - 0.5611
psi-cond 30 site 30 : 0.2444 0.1135 0.0884 - 0.5189
psi-cond 31 site 31 : 0.2444 0.1135 0.0884 - 0.5189
psi-cond 32 site 32 : 0.5101 0.2074 0.1699 - 0.8412
psi-cond 33 site 33 : 0.2444 0.1135 0.0884 - 0.5189
psi-cond 34 site 34 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 35 site 35 : 0.1111 0.0737 0.0281 - 0.3507
psi-cond 36 site 36 : 0.1111 0.0737 0.0281 - 0.3507
psi-cond 37 site 37 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 38 site 38 : 0.4518 0.2115 0.1339 - 0.8146
psi-cond 39 site 39 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 40 site 40 : 0.1635 0.0917 0.0499 - 0.4210
psi-cond 41 site 41 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 42 site 42 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 43 site 43 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 44 site 44 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 45 site 45 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 46 site 46 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 47 site 47 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 48 site 48 : 0.4235 0.2160 0.1148 - 0.8062
psi-cond 49 site 49 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 50 site 50 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 51 site 51 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 52 site 52 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 53 site 53 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 54 site 54 : 0.4235 0.2160 0.1148 - 0.8062
psi-cond 55 site 55 : 0.4235 0.2160 0.1148 - 0.8062
psi-cond 56 site 56 : 0.1858 0.1002 0.0586 - 0.4553
psi-cond 57 site 57 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 58 site 58 : 0.2006 0.1677 0.0313 - 0.6608
psi-cond 59 site 59 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 60 site 60 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 61 site 61 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 62 site 62 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 63 site 63 : 0.1617 0.0925 0.0482 - 0.4234
psi-cond 64 site 64 : 0.1617 0.0925 0.0482 - 0.4234
psi-cond 65 site 65 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 66 site 66 : 0.3831 0.2139 0.0953 - 0.7853
psi-cond 67 site 67 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 68 site 68 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 69 site 69 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 70 site 70 : 0.3391 0.2156 0.0722 - 0.7717
psi-cond 71 site 71 : 0.1374 0.0883 0.0357 - 0.4071
psi-cond 72 site 72 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
CPU time= 0 seconds (0.00 min)