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PRESENCE - Presence/Absence-Site Occupancy data analysis
Tue May 30 20:56:35 2017, Version 12.0_170523.
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
==>i=paodata.pao
==>j=.\pres36f05796407.dm
==>l=pres_psi(1)p(obs).out
==>
==>quiet
==>maxfn=32000
==>name=psi(1)p(Obs)
==>lmt=1
varcov: nsig=6 eps=1.000000e-002
no model name N,T-->72,5
********* Input Data summary *******
Number of sites = 72
Number of sampling occasions = 5
Number of states = 0
Number of missing observations = 98
Data checksum = 53860
NSiteCovs-->1
site_covname[0]=psi.int
NSampCovs-->3
samp_covname[0]=p.int
samp_covname[1]=p.Obs2
samp_covname[2]=p.Obs3
Primary periods=1 Secondary periods: 5
Naive occupancy estimate = 0.4861
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Weta
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N=72 T=5 Groups=1 bootstraps=0
-->site 72
Matrix 1: rows=2, cols=2
-,a1
psi 1
========================
Matrix 2: rows=6, cols=4
-,b1,b2,b3
p1 1 p.Obs2 p.Obs3
p2 1 p.Obs2 p.Obs3
p3 1 p.Obs2 p.Obs3
p4 1 p.Obs2 p.Obs3
p5 1 p.Obs2 p.Obs3
========================
Matrix 3: rows=0, cols=0
========================
Matrix 4: rows=0, cols=0
========================
Matrix 5: rows=0, cols=0
========================
Matrix 6: rows=0, cols=0
========================
modtype=1
Custom Model:
Number of significant digits = 7.3
Model has been fit using the logistic link.
Number of parameters = 4
Number of function calls = 82
-2log(likelihood) = 255.3578
AIC = 263.3578
Untransformed Estimates of coefficients for covariates (Beta's)
======================================================================
estimate std.error
A1 psi : 0.486237 0.374028
B1 p1 : -1.262983 0.363637
B2 p1.p.Obs2 : 0.768475 0.441482
B3 p1.p.Obs3 : 1.041381 0.431385
============================================================
Individual Site estimates of <psi>
Site estimate Std.err 95% conf. interval
psi 1 site 1 : 0.6192 0.0882 0.4386 - 0.7719
============================================================
Individual Site estimates of <p1>
Site estimate Std.err 95% conf. interval
p1 1 site 1 : 0.2205 0.0625 0.1218 - 0.3658
p2 1 site 1 : 0.4448 0.0808 0.2968 - 0.6033
p3 1 site 1 : 0.3788 0.0797 0.2389 - 0.5423
p4 1 site 1 : 0.4448 0.0808 0.2968 - 0.6033
p5 1 site 1 : . . . - .
============================================================
DERIVED parameter - Psi-conditional = [Pr(occ | detection history)]
Site psi-cond Std.err 95% conf. interval
psi-cond 1 site 1 : 0.1953 0.1028 0.0631 - 0.4666
psi-cond 2 site 2 : 0.1953 0.1028 0.0631 - 0.4666
psi-cond 3 site 3 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 4 site 4 : 0.1953 0.1028 0.0631 - 0.4666
psi-cond 5 site 5 : 0.1953 0.1028 0.0631 - 0.4666
psi-cond 6 site 6 : 0.1953 0.1028 0.0631 - 0.4666
psi-cond 7 site 7 : 0.1953 0.1028 0.0631 - 0.4666
psi-cond 8 site 8 : 0.1953 0.1028 0.0631 - 0.4666
psi-cond 9 site 9 : 0.1953 0.1028 0.0631 - 0.4666
psi-cond 10 site 10 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 11 site 11 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 12 site 12 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 13 site 13 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 14 site 14 : 0.2335 0.1132 0.0810 - 0.5128
psi-cond 15 site 15 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 16 site 16 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 17 site 17 : 0.3042 0.1168 0.1291 - 0.5631
psi-cond 18 site 18 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 19 site 19 : 0.3042 0.1168 0.1291 - 0.5631
psi-cond 20 site 20 : 0.2542 0.1126 0.0962 - 0.5219
psi-cond 21 site 21 : 0.3804 0.1216 0.1825 - 0.6279
psi-cond 22 site 22 : 0.3804 0.1216 0.1825 - 0.6279
psi-cond 23 site 23 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 24 site 24 : 0.3804 0.1216 0.1825 - 0.6279
psi-cond 25 site 25 : 0.3804 0.1216 0.1825 - 0.6279
psi-cond 26 site 26 : 0.3042 0.1168 0.1291 - 0.5631
psi-cond 27 site 27 : 0.3042 0.1168 0.1291 - 0.5631
psi-cond 28 site 28 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 29 site 29 : 0.3042 0.1168 0.1291 - 0.5631
psi-cond 30 site 30 : 0.2542 0.1126 0.0962 - 0.5219
psi-cond 31 site 31 : 0.2542 0.1126 0.0962 - 0.5219
psi-cond 32 site 32 : 0.2542 0.1126 0.0962 - 0.5219
psi-cond 33 site 33 : 0.2542 0.1126 0.0962 - 0.5219
psi-cond 34 site 34 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 35 site 35 : 0.1747 0.0975 0.0533 - 0.4433
psi-cond 36 site 36 : 0.1747 0.0975 0.0533 - 0.4433
psi-cond 37 site 37 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 38 site 38 : 0.3804 0.1216 0.1825 - 0.6279
psi-cond 39 site 39 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 40 site 40 : 0.2542 0.1126 0.0962 - 0.5219
psi-cond 41 site 41 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 42 site 42 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 43 site 43 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 44 site 44 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 45 site 45 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 46 site 46 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 47 site 47 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 48 site 48 : 0.2136 0.1068 0.0724 - 0.4857
psi-cond 49 site 49 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 50 site 50 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 51 site 51 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 52 site 52 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 53 site 53 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 54 site 54 : 0.2136 0.1068 0.0724 - 0.4857
psi-cond 55 site 55 : 0.2136 0.1068 0.0724 - 0.4857
psi-cond 56 site 56 : 0.2136 0.1068 0.0724 - 0.4857
psi-cond 57 site 57 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 58 site 58 : 0.1621 0.0953 0.0466 - 0.4336
psi-cond 59 site 59 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 60 site 60 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 61 site 61 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 62 site 62 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 63 site 63 : 0.3042 0.1168 0.1291 - 0.5631
psi-cond 64 site 64 : 0.3042 0.1168 0.1291 - 0.5631
psi-cond 65 site 65 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 66 site 66 : 0.3042 0.1168 0.1291 - 0.5631
psi-cond 67 site 67 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 68 site 68 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 69 site 69 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psi-cond 70 site 70 : 0.2809 0.1197 0.1090 - 0.5551
psi-cond 71 site 71 : 0.2809 0.1197 0.1090 - 0.5551
psi-cond 72 site 72 : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
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